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一、综合办公室

负责党务、行政、人事、纪检、工会、计划生育等工作。

二、荔城海巡执法大队

主要负责日常静态监管。

三、东洲海巡执法大队

主要负责政务服务。

四、仙村海巡执法大队（增城智管分中心）

主要负责电子巡航监管（兼负处值班室职责）。

五、西洲海巡执法大队

主要负责日常动态监管。